|
|
Vývoj vybraných CD znaků a jejich role ve fylogenezi imunitního systému člověka
Podolská, Tereza ; Růžičková, Šárka (vedoucí práce) ; Vinkler, Michal (oponent)
V první části práce byl zjišťován původ vybraných povrchových CD znaků člověka, konkrétně molekul CD19, CD20, CD21, CD24, CD27 a CD38. Dále byly v práci mezidruhově porovnávány sekvence nukleotidů a aminokyselin těchto molekul pomocí in silico přístupu. Využity byly bioinformatické databáze sekvencí vybraných molekul na úrovni DNA, mRNA a proteinu, například GeneBank, NCBI BLAST, Homologene a OrthoDB. Záměrem bylo na doménové úrovni identifikovat nejpůvodnější organismy, u nichž lze sledovaný protein poprvé nalézt. V N-koncové doméně molekuly CD38 ptáků byla nalezena sekvence vykazující významnou podobnost s archebakteriální flagelinovou doménou. Tato flagelinová sekvence se u ptačí molekuly CD38 nachází v oblasti transmembránové domény, což naznačuje, že výskyt této sekvence mohl se vznikem tramsmembránové domény souviset. Použitý postup by bylo možné zařadit do komparativních hybridizačních studií jako nástroj v přípravné nelaboratorní fázi výzkumu existence paralogů a ortologů u fylogeneticky starých druhů. Klíčová slova: CD znak, imunocyt, B lymfocyt, vrozená a adaptivní imunita, databáze sekvencí, aminokyselina, nukleotid
|
|
|
Vývoj vybraných CD znaků a jejich role ve fylogenezi imunitního systému člověka
Podolská, Tereza ; Růžičková, Šárka (vedoucí práce) ; Vinkler, Michal (oponent)
V první části práce byl zjišťován původ vybraných povrchových CD znaků člověka, konkrétně molekul CD19, CD20, CD21, CD24, CD27 a CD38. Dále byly v práci mezidruhově porovnávány sekvence nukleotidů a aminokyselin těchto molekul pomocí in silico přístupu. Využity byly bioinformatické databáze sekvencí vybraných molekul na úrovni DNA, mRNA a proteinu, například GeneBank, NCBI BLAST, Homologene a OrthoDB. Záměrem bylo na doménové úrovni identifikovat nejpůvodnější organismy, u nichž lze sledovaný protein poprvé nalézt. V N-koncové doméně molekuly CD38 ptáků byla nalezena sekvence vykazující významnou podobnost s archebakteriální flagelinovou doménou. Tato flagelinová sekvence se u ptačí molekuly CD38 nachází v oblasti transmembránové domény, což naznačuje, že výskyt této sekvence mohl se vznikem tramsmembránové domény souviset. Použitý postup by bylo možné zařadit do komparativních hybridizačních studií jako nástroj v přípravné nelaboratorní fázi výzkumu existence paralogů a ortologů u fylogeneticky starých druhů. Klíčová slova: CD znak, imunocyt, B lymfocyt, vrozená a adaptivní imunita, databáze sekvencí, aminokyselina, nukleotid
|
|
|
Imunofenotypové rozdíly v B lymfocytárních populacích non-memory B lymfocytů u zdravých kontrol a pacientů s imunopatologiemi.
Polák, Milan ; Růžičková, Šárka (vedoucí práce) ; Šplíchal, Igor (oponent)
B-lymfocyty jsou subpopulace buněk charakterizované zejména tím, že na svém povrchu nesou klonálně diversifikovaný membránový imunoglobulin sloužící k rozpoznávání různých antigenů. Spolu s ostatními imunocyty hrají centrální roli v adaptivním imunitním systému, který se svým působením podílí na obraně organismu proti širokému spektru patogenů. V současné době narůstají důkazy o tom, že se různé B lymfocytární subpopulace přímo nebo nepřímo uplatňují v patogenezi mnoha chorob. Avšak dosud máme jen velmi omezené poznatky o tom, jak jsou jednotlivá diferenciační stádia B lymfocytů do patologických procesů zapojena a jak samotný průběh nemoci, případně léčby, ovlivňuje B buněčnou homeostázu. Proto byla tato práce zaměřena na analýzu změn profilu B buněčných subpopulací za patologického stavu, zjištění míry asociace mezi jednotlivými B buněčnými subpopulacemi a jejich souvislost s klinickými parametry. Pomocí polychromatické průtokové cytometrie jsme analyzovali frekvence 11 B buněčných subpopulací zahrnující stádia od tranzientních B-lymfocytů, až po efektorové plazmatické buňky produkující protilátky. Vyšetřili jsme celkem 81 jedinců, z toho 22 zdravých kontrol a 59 pacientů s různými patologiemi (revmatoidní artritida/RA - 29, kolorektální karcinom/CRC - 19, ostatní choroby - 11). Zajímavá data byla...
|
host ::
RSS.